Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RarbP22605 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RarbP22605 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RarbP22605 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RarbP22605 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RarbP22605 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RarbP22605 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RarbP22605 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RarbP22605 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RarbP22605 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RarbP22605 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RarbP22605 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms