Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clk1P22518 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms