Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SftpcP21841 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SftpcP21841 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SftpcP21841 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SftpcP21841 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SftpcP21841 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SftpcP21841 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SftpcP21841 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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