Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms