Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18526 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18526 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18526 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18526 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P18526 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18526 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18526 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18526 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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