Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18525 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18525 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18525 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18525 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18525 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18525 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18525 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.05■□□□□ 0
P18525 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18525 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18525 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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