Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms