Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nme1P15532 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme1P15532 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme1P15532 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms