Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrgnP13609 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrgnP13609 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms