Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn1P12960 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn1P12960 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms