Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrm1P12657 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms