Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AppP12023 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AppP12023 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AppP12023 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AppP12023 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AppP12023 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AppP12023 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AppP12023 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AppP12023 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AppP12023 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AppP12023 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AppP12023 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AppP12023 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AppP12023 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AppP12023 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AppP12023 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AppP12023 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AppP12023 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms