Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp1P11103 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp1P11103 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp1P11103 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms