Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP10400 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP10400 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PolP10400 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PolP10400 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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