Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms