Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms