Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms