Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd3P09027 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd3P09027 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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