Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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