Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NeflP08551 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NeflP08551 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NeflP08551 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NeflP08551 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NeflP08551 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NeflP08551 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NeflP08551 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NeflP08551 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NeflP08551 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NeflP08551 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NeflP08551 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NeflP08551 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NeflP08551 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NeflP08551 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NeflP08551 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NeflP08551 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NeflP08551 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NeflP08551 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NeflP08551 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NeflP08551 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NeflP08551 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NeflP08551 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms