Protein–RNA interactions for Protein: P07903

Ercc1, DNA excision repair protein ERCC-1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc1P07903 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc1P07903 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc1P07903 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc1P07903 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc1P07903 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc1P07903 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc1P07903 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ercc1P07903 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms