Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtrP07309 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtrP07309 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TtrP07309 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtrP07309 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TtrP07309 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TtrP07309 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtrP07309 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtrP07309 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TtrP07309 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtrP07309 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtrP07309 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtrP07309 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TtrP07309 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TtrP07309 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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