Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf3P05524 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms