Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa2P05367 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa2P05367 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa2P05367 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms