Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa7P02830 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms