Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms