Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01800 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01800 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01800 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01800 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01800 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01800 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01800 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01800 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01800 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01800 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01800 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01800 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01800 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01800 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01800 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01800 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01800 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms