Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms