Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PomcP01193 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PomcP01193 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PomcP01193 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PomcP01193 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PomcP01193 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PomcP01193 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PomcP01193 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PomcP01193 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PomcP01193 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PomcP01193 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PomcP01193 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms