Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb2O88838 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms