Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BlmO88700 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BlmO88700 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BlmO88700 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BlmO88700 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BlmO88700 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BlmO88700 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BlmO88700 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BlmO88700 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BlmO88700 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BlmO88700 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BlmO88700 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BlmO88700 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BlmO88700 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BlmO88700 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BlmO88700 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BlmO88700 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BlmO88700 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BlmO88700 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BlmO88700 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BlmO88700 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BlmO88700 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BlmO88700 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BlmO88700 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms