Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl22O88430 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms