Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AvilO88398 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AvilO88398 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AvilO88398 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AvilO88398 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AvilO88398 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AvilO88398 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AvilO88398 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AvilO88398 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AvilO88398 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AvilO88398 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AvilO88398 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms