Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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