Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms