Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbrO54799 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NmbrO54799 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NmbrO54799 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms