Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp100O35892 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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