Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms