Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms