Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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H2-Q1O19441 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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H2-Q1O19441 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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H2-Q1O19441 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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H2-Q1O19441 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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H2-Q1O19441 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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H2-Q1O19441 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms