Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sypl1O09117 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sypl1O09117 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms