Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms