Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MsmbO08540 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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