Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17078M0QW51 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms