Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer2J3QPU5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms