Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms