Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm6594J3QM43 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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