Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20830J3KML6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms