Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms