Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms